En enero de 2006, la Fuerza Internacional de Asistencia para la Seguridad (ISAF) se desplegó en Afganistán para ayudar a los militares estadounidenses y británicos en la lucha contra los talibanes paramilitares islamistas. El gobierno estadounidense acusó a los talibanes de albergar al jefe de al-Qaeda, Osama bin Laden, y exigió su extradición. Los líderes talibanes se negaron a cumplir con esta demanda, diciendo que Estados Unidos no proporcionó evidencia de la culpabilidad de Osama en los ataques del 11 de septiembre de 2001.
A fines de 2001, la estructura militar de los talibanes quedó prácticamente destruida y la resistencia de sus partidarios tomó la forma de un movimiento guerrillero. Los países occidentales han invertido mucho en el desarrollo de la democracia y la estructura social de Afganistán. En 2004, Hamid Karzai, un político lo suficientemente leal a Occidente, ganó las primeras elecciones presidenciales del país. Sin embargo, la resistencia de los partidarios de los talibanes no pudo ser reprimida. La guerrilla luchó ferozmente a pesar de la abrumadora superioridad militar de la ISAF.
Francia, al igual que otros miembros de la alianza, sufrió pérdidas en equipos y mano de obra. Durante los 10 años de la guerra en Afganistán, 83 soldados murieron y varias veces más resultaron heridos. La decisión de involucrar a Francia en la operación militar no fue muy popular entre la población, y los informes de bajas entre los soldados franceses aumentaron el descontento con el gobierno.
El 20 de enero de 2012, en la provincia de Kapisa, un hombre con uniforme del ejército afgano disparó contra 4 e hirió a 16 soldados franceses. Posteriormente, Nicolas Sarkozy (presidente francés de 2007 a 2012) dijo que dado que el gobierno afgano no puede garantizar la seguridad de las tropas francesas, Francia suspende su presencia militar en ese país. Sarkozy prometió retirar las tropas de Afganistán a principios de 2014.
En 2012, François Hollande fue elegido presidente de Francia, quien anunció un nuevo plan para retirarse de Afganistán. 2.000 militares serán retirados a finales de 2012, 1.400 permanecerán como instructores y para custodiar instalaciones sociales. El presidente explicó su decisión por el hecho de que el peligro de los terroristas ha disminuido, la democracia se ha fortalecido y el país debe desarrollarse de forma independiente. El jefe de la república prometió que Francia seguiría apoyando a Afganistán, pero de otra forma.
